Se encuentra Andagoia en un terreno elevado al Norte del valle de Kuartango, entre las laderas del «El Castillo», «La Llana» y el «Alto de Santa Cruz». Bordean las laderas caminos viejos que conducen a Izarra y Abezia. Desde el puente de Ilumbe, encrucijada de caminos reales en la ruta de Kuartango a Urkabustaiz, un corto camino llegaba hasta AndagoIa atravesando por un puente antiguo de dos ojos un pequeño afluente del Bayas. Lugar fronterizo con las tierras de Urkabustaiz poseyó una torre que sería del señor de Ayala, y que fuera destruida en las luchas comuneras de enfrentamientos con Carlos !. En la primera mitad del siglo XVI pasaba AndagoIa a las páginas de la historia americana con la figura de Pascual de AndagoIa, protodescubridor de Perú. Participó en las expediciones que reconocían las tierras costeras del Pacífico al mando de Nuñez de Balboa, y nombrado por el rey «adelantado del río San Juan». El lugar de Andagoia contó con clérigos cultos, cabe destacar el caso de Martín Martínez de Andagoia, que solicitó y obtuvo del pontífice Julio II en 1506, importantes indulgencias para la iglesia de Santa María de Andagoia.

En 1257 se registraba el lugar de «Andagoyen» en la carta del obispo Aznar. Al finalizar el siglo XVI contaba Andagoia con treinta vecinos. Por aquel entonces el pueblo hablaba euskara casi de forma exclusiva. Un siglo más tarde la población había descendido alarmantemente llegando a los dieciocho vecinos. Un siglo más tarde la población alcanzó su punto más alto llegando a 152 habitantes; había entonces en Andagoia tres casas hidalgas y seis artesanos, cinco tejedores y un sastre. Al comenzar el siglo actual contaba Andagoia con 110 habitantes y en el último padrón de 2017 contaba con 25 habitantes.